有三組光源，白光光源一組，紫外光源兩組分別是365nm和254nm。

　　首先是白光光源，通常作為系統(tǒng)照明光源使用，即放置或調整DNA膠或蛋白膠位置，或在對鏡頭調整聚焦時使用，當然在對非透明材質的蛋白膠或其他成像物質進行成像時也需開啟反射白光。

　　二個是：254nm這是一個比較常用的檢測波長，大多數(shù)含有苯環(huán)的有機化合物在此有吸收，不過這樣它的特征性就不強了！而且會引來很多干擾，所以還是建議對不同物質選擇不同的檢測波長，一是提高靈敏度和選擇性，二是減少不必要的干擾。無色的成分在245-365nm的紫外燈下檢視可以看到在這個范圍內存在光吸收的成分所發(fā)出的熒光。

　　三個：365nm光源主要適用于制備觀察以及切割條帶，減少對DNA的破壞，并減小對人的傷害。

　　紫外反射燈源，使用并不廣泛，只是在非透明材質的DNA跑膠載體如紙層析等的成像才需要使用。往往比較常用的還是透明的瓊脂糖凝膠與聚丙烯酰胺凝膠，透射光源*可以滿足。

　　還有一個不常用的302nm波長，主要用于DNA膠拍攝，由于DNA常用的熒光染料是EB（即Ethidiumbromide，溴化乙錠），而用標準302nm紫外光透射儀激發(fā)并放射出橙紅色信號，可用拍攝到。